Из личного опыта:
Большие проблемы несовместимости OpenOffice и Microsoft Office. В основном это касается таблиц Exel, и документов Word с таблицами и рисунками. OpenOffice в большом количестве случаев неправильно отображает такие файлы, или коверкает их так, что потом они неправильно отображаются в Microsoft Office. Речь идет о файлах с расширениями .doc и .xls.
А если учитывать, что у большинства пользователей стоит Microsoft Office, пусть и сломанный, то все-таки лучше имхо ставить Microsoft, особенно для работы.